ПО Thermo Scientific CryoTomo Software Suite

Расширенная информация

Интегрированное программное решение для криоэлектронной томографии

Программный комплекс Thermo Scientific CryoTomo Software Suite разработан для обеспечения высокоэффективного рабочего процесса криоэлектронной томографии (Cryo-ET) как для новых, так и для опытных пользователей. Он представляет собой набор интегрированных инструментов, которые оптимизируют сбор серий наклона и 3D-анализ. Комплекс доступен для крио-просвечивающих электронных микроскопов (крио-ТЭМ) Thermo Scientific и работает на базе программного обеспечения Tomography 5 и Tomo Live с поддержкой многосеточного режима, а также включает инструменты для расширенной коррекции движения, навигации и управления данными.

 

 

Возможности программного комплекса CryoTomo

Раскройте полный потенциал криоэлектронной томографии.

Изучите передовые инструменты и функции программного комплекса CryoTomo Software Suite. Их слаженная работа позволяет ускорить планирование заданий, сбор данных и 3D-анализ в рамках рабочих процессов криоэлектронной томографии.

 

Сбор данных криоэлектронной томографии.

Собирайте данные эффективнее с помощью интуитивно понятного ПО Tomography 5, которое обеспечивает пакетный сбор 3D-данных и расширенную коррекцию движения как для начинающих, так и для опытных пользователей.

 

Функциональные возможности включают:

 

Автоматическое картирование кассеты

Автоматическое создание карт (картирование) для 12 сеток, находящихся в автозагрузчике (Autoloader), с использованием наборов тайлов на малом увеличении. Это позволяет быстро и без участия оператора проводить оценку качества сеток и скрининг крио-ламелл. Созданные атласы упрощают выбор участков для съемки на высоком увеличении.

 

Автоматический сбор поисковых карт

Автоматический сбор наборов тайлов на среднем увеличении поверх квадратов сетки или ламелл для идентификации областей интереса перед началом многоточечного сбора серий наклона. Поисковые карты задаются на атласах и ставятся в очередь для автономного сбора данных.

 

Автоматическая многоточечная съемка

Захват нескольких изображений для каждого угла наклона с минимальным перемещением предметного столика, что значительно ускоряет пакетную томографию. Выберите области интереса на поисковых картах и поставьте томограммы в очередь для автоматизированного сбора, достигая максимальной эффективности.

 

Гибкие варианты вывода данных с детектора прямого детектирования электронов

Детектор Falcon 4i позволяет выполнять коррекцию движения в реальном времени с возможностью вывода серий наклона в разрешении 4k или 8k. Используйте 4k для эффективной обработки данных или 8k для задач, требующих высокого разрешения, таких как усреднение субтомограмм (sub-tomogram averaging), что позволяет оптимизировать рабочий процесс под различные цели визуализации.

 

Энергетический фильтр Selectris

Thermo Scientific Selectris X Imaging Filter помогает повысить контраст и разрешение за счет фильтрации нулевых потерь (т. е. удаления неупруго рассеянных электронов), что обеспечивает существенное улучшение соотношения сигнал/шум.

 

Планирование сбора томографических данных

Добавление поддержки многосеточного режима максимально увеличивает преимущества параллелизации задач, обеспечивая автономный сбор данных для нескольких сеток сразу.

 

Функциональные возможности включают:

 

Параллелизация задач

Ставьте в очередь новые задания на сбор данных, пока идет запись атласов или поисковых карт, и отмечайте позиции для серий наклона прямо во время текущих сеансов съемки. Этот параллельный рабочий процесс сокращает время ожидания и максимально повышает эффективность использования микроскопа.

 

Многопакетная томография (Multi-batch tomography)

Запускайте пакетный сбор данных сразу после определения позиции, а затем продолжайте настройку для других сеток, используя ранее записанные поисковые карты. После смены сетки в автозагрузчике система точно восстанавливает положение целевых участков для непрерывного сбора 3D-данных.

 

Анализ данных криоэлектронной томографии

Оценивайте качество образцов с помощью инновационных инструментов для беспараметрической реконструкции и визуализации томограмм непосредственно в процессе съемки («на лету»).

 

Функциональные возможности включают:

 

Программное обеспечение Tomo Live

Tomo Live выполняет коррекцию движения в реальном времени, безмаркерное совмещение и 3D-реконструкцию непосредственно во время сбора серий наклона. Мгновенно оценивайте качество данных и экспортируйте предварительно обработанные томограммы для дальнейшего анализа в стандартных инструментах для крио-ЭМ. Программное обеспечение Tomo Live работает на сервере платформы управления данными микроскопа, а пользовательский интерфейс интегрирован в портал Thermo Scientific CryoFlow.

 

Discovery Viewer

Визуализируйте и анализируйте большие наборы данных с помощью Discovery Viewer. Связывайте томограммы с их позициями на сетке и легко сравнивайте различные участки образца для изучения клеточного контекста с помощью интуитивно понятной навигации.